WormLikeChain

WormLikeChain #

Worm-Like chain modelに基づいたポテンシャルです。

\[U(r) = \frac{k_B T}{p} \left(\frac{l_c}{4} \left[ \frac{1}{1 - \frac{r}{l_c}} - 1 \right] - \frac{r}{4} + \frac{r^2}{2l_c}\right)\]

#

[[forcefields.local]]
interaction = "BondLength"
potential   = "WormLikeChain"
topology    = "bond"
parameters  = [
    {indices = [0, 1], offset = 100, p = 5.0, lc = 100.0},
    # ...
]

入力 #

  • p: 浮動小数点数型
    • ポリマーの持続長です。
  • lc: 浮動小数点数型
    • ポリマーの最大長です。
  • indices: 整数の配列型(長さ: 2)
    • どの粒子の間に適用するかを指定します。最初の粒子は0番めです。
  • offset: 整数型(省略可能)
    • インデックスに加算する値です。省略可能です。

Remarks #

This feature is developed by contributor, @yutakasi634.