AttractiveGo

AttractiveGoContactPotential #

Go-Contact potentialの引力項です。

\[U(r) = \begin{cases} -k & (r < r_0) \\ k\left[5\left(\frac{r_0}{r}\right)^{12} - 6\left(\frac{r_0}{r}\right)^{10}\right] & otherwise \end{cases}\]

#

[[forcefields.local]]
interaction = "BondLength"
potential   = "AttractiveGoContact"
topology    = "none"
parameters = [
    {indices = [0, 1], v0 = 1.0, k = 0.1},
    # ...
]

入力 #

  • v0: 浮動小数点数型
    • 最安定距離を指定します。
  • k: 浮動小数点数型
    • パラメータの強さを指定します。
  • indices: 整数の配列型(長さ: 2)
    • どの粒子の間に適用するかを指定します。最初の粒子は0番めです。
  • offset: 整数型(省略可能)
    • インデックスに加算する値です。省略可能です。