WCAPotential #
よく知られたWCA (Weeks-Chandler-Andersen) ポテンシャルです。Lennard-Jonesの斥力項のみを取り出した形のポテンシャルです。
\[U(r) = \begin{cases} 4\epsilon \left[\left(\frac{\sigma_{ij}}{r}\right)^{12} - \left(\frac{\sigma_{ij}}{r}\right)^6\right] + \epsilon & (r < \sigma_{ij}\sqrt[6]{2})\\ 0 & (r \geq \sigma_{ij}\sqrt[6]{2})\\ \end{cases}\]例 #
パラメータを指定するには二通りの方法があります。
個々の粒子のパラメータを指定し、Lorentz-Berthelot則でペアのパラメータを計算する方法と、
[[forcefields.global]]
interaction = "Pair"
potential = "WCA"
ignore.molecule = "Nothing"
ignore.particles_within.bond = 3
ignore.particles_within.contact = 1
spatial_partition = {type = "CellList", margin = 0.2}
parameters = [
{index = 0, offset = 100, sigma = 2.0, epsilon = 10.0},
]
粒子の名前を指定し、表でペアのパラメータを与える方法があります。
[[forcefields.global]]
interaction = "Pair"
potential = "LennardJonesAttractive"
ignore.molecule = "Nothing"
ignore.particles_within.bond = 3
ignore.particles_within.contact = 1
spatial_partition = {type = "CellList", margin = 0.2}
table.A.A = {sigma = 1.0, epsilon = 2.0}
table.A.B = {sigma = 3.0, epsilon = 1.0} # B.A will be the same
table.B.B = {sigma = 1.0, epsilon = 1.5}
parameters = [
{index = 0, offset = 100, name = "A"},
{index = 1, offset = 100, name = "B"},
# ...
]
入力 #
index: 整数型- 粒子の番号です。最初の粒子は0番目です。
offset: 整数型（省略可能）- 番号のオフセットです。省略可能です。グループ内番号などを使う際に便利です。
sigma: 浮動小数点数型- 粒子のサイズを指定します。テーブルを用意する場合、これは不要です。
epsilon: 浮動小数点数型- ポテンシャルの強さを指定します。テーブルを用意する場合、これは不要です。
name: 文字列型- 粒子の名前です。テーブルを用意する場合、これは必須です。
このポテンシャルは
\( r = \sigma\sqrt[6]{2} \)
で正確に0となるため、カットオフには常にこの値が使用されます。
よって、cutoffを指定する必要はありません。
入力の他の部分は、Pairを参照してください。