SimulatedAnnealing #

焼きなまし（Simulated Annealing）法のためのシミュレータです。

systemを一つ、forcefieldを一つ要求します。

Example #

[simulator]
type           = "SimulatedAnnealing"
boundary_type  = "Unlimited"
precision      = "double"
parallelism    = "OpenMP" # optional
delta_t        = 0.1
total_step     = 50_000
save_step      = 100
each_step      = 100
schedule.type  = "linear"
schedule.begin = 300.0 # temperature in [K]
schedule.end   = 150.0 # temperature in [K]

integrator.type = "UnderdampedLangevin"
integrator.parameters = [
    # ...
]

Input Reference #

• type: 文字列型
  • シミュレータの種類を指定します。このシミュレータを使う場合、"SimulatedAnnealing"です。
• boundary_type: 文字列型
  • 境界条件の種類を指定します。具体的な大きさは[[systems]]で指定します。
  • "Unlimited": 境界条件を設定しません。シミュレーションボックスは無限大の大きさになります。
  • "PeriodicCuboid": 直方体型の周期境界条件を指定します。
• precision: 文字列型
  • シミュレーションに用いる浮動小数点数型の種類を指定します。
  • "float": 32bit浮動小数点数を使用します。
  • "double": 64bit浮動小数点数を使用します。
• parallelism: 文字列型(省略可)
  • 並列化する際の実装を選択します。
  • "OpenMP": OpenMPを使った実装を使用します。
  • "sequencial": 並列化を行いません。省略した場合はこれが選択されます。
• seed: 整数型
  • 乱数生成器の初期化に用いるシードを設定します。
• delta_t: 浮動小数点数型
  • シミュレーションの時間刻みを指定します。
  • 時間の単位は[units]で指定した単位系に依存します。
• total_step: 整数型
  • 実行するステップ数を指定します。
• save_step: 整数型
  • 何ステップおきに状態を出力するか指定します。
• each_step: 整数型
  • 何ステップおきに温度を変更するか指定します。
• schedule: テーブル型
  • どのように温度を変更するか指定します。
• integrator: テーブル型
  • 時間積分の方法を指定します。積分方法によって必要なパラメータが異なります。
  • “BAOABLangevin”
  • “g-BAOABLangevin”
  • “UnderdampedLangevin”
  • “VelocityVerlet”
  • 参考：integrators.

schedule Table #

• type: 文字列型
  • 温度の変化させ方を指定します。以下の種類がサポートされています。
  • "linear": 線形に変化させます。
• begin: 浮動小数点数型
  • "linear"な温度変化において、時刻0での温度を指定します。単位は[K]です。
• end: 浮動小数点数型
  • "linear"な温度変化において、最終時刻での温度を指定します。単位は[K]です。